Het is de Gouden Eeuw van de Piraterij. Rebelse kapiteinen hebben de leiding over de krachtigste wapens op aarde: oorlogsschepen. In Skull & Bones™, ben jij een onverzadigde, beginnende kapitein die het pardon van de koning heeft afgewezen. Aangezien je niks te verliezen hebt, vaar je van de Caraïben naar de Indische Oceaan, een exotisch en ongetemd gebied vol met ongekende rijkdom. 

Echter zijn deze mooie en idyllische wateren ook een plek waar enorme bevolkingsgroepen, krachtige handelsorganisaties en meedogenloze piratenbendes het gevecht met elkaar aangaan voor hun deel van deze schatten. 

Tijdens je avontuur om de grootste piratenkoning te worden, bouw je een vloot aan schepen die je kunt aanpassen, ben je opzoek naar lucratieve handelsroutes en haal je andere piratenkapiteinen, memorabele karakters of andere spelers neer. Om de gevaren van de oceaan te overleven, moet je samenwerken met andere piratenkapiteinen en zo de meest invloedrijke piratenbende worden. Leid je bende naar ongekende hoogtes en ga het eindeloze gevecht aan en word heerser van de Indische Oceaan.